conda env list #Ver todos tus ambientes existentes.
# Crear un ambiente nuevo. 👀 Si no se especifica la versión, se toma la mas reciente.
conda create --name <name-env> <paquete1>=<version1> <paquete2>=<version2>
conda activate <name-env> #para activar un ambiente.
conda deactivate # para desactivar el ambiente actual.
conda list #muestra todos los paquetes (y sus versiones) en tu ambiente. Para filtrar resultados (en ambientes grandes) `conda list pandas`.
conda update <paquete> #para actualizar la versión mas reciente de un paquete.
conda install <paquete>=<version> #para poner un paquete en una versión específica.
conda remove <paquete> # para desinstalar un paquete en particular. 🗞️
conda env remove --name <name-env> #para eliminar un ambiente completo 👀.
conda install -c conda-forge boltons
#Devolver a un punto anterio y asi no tener que remover
conda list -r
conda install --revision 0 #Devolverme a larevision 0
conda list boltons #Revisar si un paq esta instalado
conda env export #Exportar tu ambiente
conda env export --no-builds #Exportar tu ambiente pero sin las versiones
conda env export --from-history #Exportar tu ambiente LA MEJOR
conda env export --from-history --file environment.yam #Exportar tu ambiente a un archivo
#Importar el ambiente
conda env create --file environment.yaml
#Ir al ambiente
conda activate py39
Mamba es una re-implementación de Conda (en C++) para la creación de ambientes virtuales. 🤖 Lo hace en paralelo, e incluye multiples optimizaciones que lo hacen más rápido.
conda install --channel conda-forge mamba
jupyter notebook
es partir un problema difícil en partes pequeñas. Cada paquete se desarrolla a su propio ritmo (no siempre preocupándose de la compatibilidad con otros módulos). 🤯
envs y creamos tres documentos: external.yml, model.yml y comunicacion.yml.Snakemake es un paquete que implementa muy bien este concepto. Es un motor de workflows 👀. Cada paso lo ejecuta con un ambiente específico.